Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SREBF1P36956 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SREBF1P36956 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SREBF1P36956 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms