Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCGF2P35227 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCGF2P35227 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCGF2P35227 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCGF2P35227 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCGF2P35227 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCGF2P35227 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCGF2P35227 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCGF2P35227 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCGF2P35227 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCGF2P35227 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCGF2P35227 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF2P35227 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF2P35227 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF2P35227 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF2P35227 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF2P35227 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF2P35227 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF2P35227 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCGF2P35227 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF2P35227 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF2P35227 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF2P35227 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCGF2P35227 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF2P35227 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCGF2P35227 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PCGF2P35227 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCGF2P35227 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PCGF2P35227 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PCGF2P35227 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCGF2P35227 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCGF2P35227 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF2P35227 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF2P35227 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PCGF2P35227 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF2P35227 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF2P35227 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF2P35227 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF2P35227 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PCGF2P35227 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCGF2P35227 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PCGF2P35227 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PCGF2P35227 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PCGF2P35227 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PCGF2P35227 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PCGF2P35227 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms