Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXA9P31269 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXA9P31269 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA9P31269 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms