Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CLIP1P30622 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
CLIP1P30622 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CLIP1P30622 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLIP1P30622 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms