Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP5DP30049 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP5DP30049 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP5DP30049 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms