Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFS1P28331 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDUFS1P28331 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDUFS1P28331 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms