Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR2AP24928 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR2AP24928 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2AP24928 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms