Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCNE1P24864 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNE1P24864 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNE1P24864 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms