Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.46
PTPRGP23470 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PTPRGP23470 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRGP23470 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms