Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME2P23368 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME2P23368 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME2P23368 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME2P23368 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME2P23368 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME2P23368 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ME2P23368 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME2P23368 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME2P23368 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME2P23368 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME2P23368 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME2P23368 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME2P23368 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME2P23368 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ME2P23368 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME2P23368 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME2P23368 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME2P23368 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME2P23368 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ME2P23368 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME2P23368 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME2P23368 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME2P23368 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME2P23368 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME2P23368 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME2P23368 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ME2P23368 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ME2P23368 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME2P23368 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ME2P23368 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ME2P23368 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME2P23368 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME2P23368 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME2P23368 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME2P23368 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME2P23368 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME2P23368 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME2P23368 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME2P23368 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME2P23368 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME2P23368 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ME2P23368 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME2P23368 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME2P23368 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME2P23368 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ME2P23368 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ME2P23368 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ME2P23368 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ME2P23368 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms