Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP8P22894 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP8P22894 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP8P22894 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP8P22894 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP8P22894 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP8P22894 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP8P22894 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP8P22894 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP8P22894 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP8P22894 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP8P22894 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP8P22894 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP8P22894 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP8P22894 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP8P22894 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP8P22894 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP8P22894 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP8P22894 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP8P22894 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP8P22894 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP8P22894 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP8P22894 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP8P22894 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP8P22894 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP8P22894 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP8P22894 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP8P22894 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP8P22894 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP8P22894 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP8P22894 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP8P22894 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP8P22894 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP8P22894 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP8P22894 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP8P22894 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP8P22894 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP8P22894 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP8P22894 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP8P22894 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP8P22894 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP8P22894 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP8P22894 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP8P22894 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP8P22894 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP8P22894 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP8P22894 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP8P22894 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP8P22894 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP8P22894 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP8P22894 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP8P22894 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP8P22894 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP8P22894 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP8P22894 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP8P22894 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP8P22894 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP8P22894 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP8P22894 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP8P22894 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP8P22894 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP8P22894 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP8P22894 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP8P22894 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP8P22894 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP8P22894 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP8P22894 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP8P22894 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP8P22894 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP8P22894 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP8P22894 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms