Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHBP21912 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHBP21912 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHBP21912 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHBP21912 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHBP21912 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHBP21912 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHBP21912 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHBP21912 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHBP21912 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDHBP21912 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHBP21912 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHBP21912 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHBP21912 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHBP21912 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHBP21912 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHBP21912 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDHBP21912 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHBP21912 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHBP21912 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHBP21912 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHBP21912 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHBP21912 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHBP21912 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHBP21912 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHBP21912 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHBP21912 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDHBP21912 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDHBP21912 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHBP21912 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHBP21912 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHBP21912 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHBP21912 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHBP21912 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHBP21912 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDHBP21912 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDHBP21912 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHBP21912 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHBP21912 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHBP21912 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHBP21912 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHBP21912 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHBP21912 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHBP21912 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDHBP21912 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDHBP21912 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDHBP21912 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHBP21912 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHBP21912 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHBP21912 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDHBP21912 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms