Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD247P20963 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD247P20963 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD247P20963 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD247P20963 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD247P20963 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD247P20963 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD247P20963 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CD247P20963 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CD247P20963 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD247P20963 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CD247P20963 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD247P20963 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD247P20963 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD247P20963 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD247P20963 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD247P20963 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD247P20963 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD247P20963 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CD247P20963 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD247P20963 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CD247P20963 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD247P20963 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD247P20963 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD247P20963 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD247P20963 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD247P20963 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD247P20963 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD247P20963 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD247P20963 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD247P20963 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD247P20963 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD247P20963 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD247P20963 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD247P20963 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD247P20963 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD247P20963 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD247P20963 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD247P20963 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD247P20963 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD247P20963 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD247P20963 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD247P20963 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD247P20963 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD247P20963 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD247P20963 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD247P20963 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD247P20963 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD247P20963 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD247P20963 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD247P20963 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD247P20963 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD247P20963 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD247P20963 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD247P20963 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD247P20963 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD247P20963 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD247P20963 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD247P20963 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD247P20963 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD247P20963 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD247P20963 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD247P20963 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD247P20963 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD247P20963 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD247P20963 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD247P20963 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD247P20963 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD247P20963 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD247P20963 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CD247P20963 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD247P20963 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD247P20963 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CD247P20963 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD247P20963 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD247P20963 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD247P20963 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD247P20963 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD247P20963 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD247P20963 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD247P20963 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD247P20963 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD247P20963 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD247P20963 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD247P20963 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD247P20963 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD247P20963 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms