Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RAB3AP20336 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RAB3AP20336 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms