Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-DPA1P20036 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HLA-DPA1P20036 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DPA1P20036 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms