Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNB2P17787 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNB2P17787 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNB2P17787 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms