Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
UBTFP17480 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
UBTFP17480 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
UBTFP17480 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
UBTFP17480 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
UBTFP17480 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
UBTFP17480 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
UBTFP17480 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
UBTFP17480 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
UBTFP17480 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
UBTFP17480 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
UBTFP17480 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
UBTFP17480 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
UBTFP17480 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
UBTFP17480 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
UBTFP17480 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
UBTFP17480 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
UBTFP17480 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
UBTFP17480 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
UBTFP17480 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
UBTFP17480 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
UBTFP17480 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
UBTFP17480 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
UBTFP17480 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
UBTFP17480 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
UBTFP17480 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
UBTFP17480 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
UBTFP17480 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
UBTFP17480 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
UBTFP17480 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
UBTFP17480 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
UBTFP17480 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
UBTFP17480 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
UBTFP17480 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
UBTFP17480 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
UBTFP17480 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
UBTFP17480 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
UBTFP17480 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
UBTFP17480 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
UBTFP17480 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
UBTFP17480 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
UBTFP17480 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
UBTFP17480 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
UBTFP17480 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
UBTFP17480 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
UBTFP17480 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
UBTFP17480 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
UBTFP17480 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
UBTFP17480 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
UBTFP17480 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
UBTFP17480 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
UBTFP17480 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
UBTFP17480 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
UBTFP17480 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
UBTFP17480 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
UBTFP17480 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
UBTFP17480 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.53
UBTFP17480 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
UBTFP17480 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
UBTFP17480 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
UBTFP17480 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
UBTFP17480 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
UBTFP17480 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
UBTFP17480 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
UBTFP17480 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
UBTFP17480 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
UBTFP17480 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
UBTFP17480 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
UBTFP17480 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
UBTFP17480 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
UBTFP17480 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
UBTFP17480 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
UBTFP17480 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
UBTFP17480 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
UBTFP17480 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
UBTFP17480 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
UBTFP17480 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
UBTFP17480 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
UBTFP17480 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
UBTFP17480 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
UBTFP17480 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
UBTFP17480 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
UBTFP17480 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
UBTFP17480 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
UBTFP17480 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
UBTFP17480 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
UBTFP17480 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
UBTFP17480 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
UBTFP17480 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
UBTFP17480 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
UBTFP17480 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
UBTFP17480 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
UBTFP17480 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
UBTFP17480 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
UBTFP17480 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
UBTFP17480 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
UBTFP17480 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
UBTFP17480 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
UBTFP17480 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
UBTFP17480 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms