Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ZKSCAN1P17029 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZKSCAN1P17029 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN1P17029 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN1P17029 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN1P17029 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN1P17029 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN1P17029 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN1P17029 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN1P17029 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZKSCAN1P17029 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZKSCAN1P17029 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171 ms