Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF4P15884 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF4P15884 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF4P15884 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF4P15884 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF4P15884 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF4P15884 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF4P15884 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF4P15884 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TCF4P15884 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF4P15884 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF4P15884 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF4P15884 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF4P15884 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF4P15884 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF4P15884 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF4P15884 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TCF4P15884 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF4P15884 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF4P15884 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF4P15884 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF4P15884 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF4P15884 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF4P15884 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF4P15884 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF4P15884 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF4P15884 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF4P15884 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TCF4P15884 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF4P15884 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF4P15884 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF4P15884 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF4P15884 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF4P15884 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF4P15884 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF4P15884 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TCF4P15884 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF4P15884 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF4P15884 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF4P15884 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TCF4P15884 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF4P15884 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF4P15884 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF4P15884 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF4P15884 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF4P15884 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF4P15884 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF4P15884 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TCF4P15884 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF4P15884 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF4P15884 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF4P15884 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF4P15884 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF4P15884 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF4P15884 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF4P15884 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TCF4P15884 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF4P15884 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF4P15884 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF4P15884 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF4P15884 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TCF4P15884 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF4P15884 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF4P15884 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF4P15884 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF4P15884 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF4P15884 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF4P15884 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF4P15884 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF4P15884 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF4P15884 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF4P15884 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TCF4P15884 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF4P15884 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF4P15884 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF4P15884 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF4P15884 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF4P15884 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TCF4P15884 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TCF4P15884 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF4P15884 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF4P15884 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TCF4P15884 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms