Protein–RNA interactions for Protein: P13674

P4HA1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4HA1P13674 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P4HA1P13674 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P4HA1P13674 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms