Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT13P13646 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT13P13646 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT13P13646 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT13P13646 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT13P13646 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT13P13646 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT13P13646 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT13P13646 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT13P13646 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT13P13646 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT13P13646 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT13P13646 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT13P13646 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT13P13646 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT13P13646 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT13P13646 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT13P13646 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT13P13646 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT13P13646 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT13P13646 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT13P13646 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT13P13646 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT13P13646 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT13P13646 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT13P13646 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT13P13646 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT13P13646 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT13P13646 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT13P13646 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT13P13646 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT13P13646 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT13P13646 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT13P13646 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT13P13646 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT13P13646 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT13P13646 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT13P13646 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT13P13646 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT13P13646 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT13P13646 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT13P13646 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT13P13646 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT13P13646 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT13P13646 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KRT13P13646 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT13P13646 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT13P13646 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT13P13646 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT13P13646 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KRT13P13646 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms