Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARGP13631 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARGP13631 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARGP13631 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RARGP13631 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARGP13631 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARGP13631 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RARGP13631 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARGP13631 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARGP13631 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARGP13631 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARGP13631 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARGP13631 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARGP13631 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARGP13631 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARGP13631 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RARGP13631 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARGP13631 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARGP13631 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARGP13631 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARGP13631 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARGP13631 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARGP13631 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARGP13631 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARGP13631 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARGP13631 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARGP13631 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARGP13631 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARGP13631 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARGP13631 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARGP13631 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARGP13631 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARGP13631 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARGP13631 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARGP13631 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARGP13631 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARGP13631 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARGP13631 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARGP13631 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARGP13631 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARGP13631 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARGP13631 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARGP13631 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARGP13631 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARGP13631 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARGP13631 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARGP13631 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARGP13631 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RARGP13631 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RARGP13631 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARGP13631 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARGP13631 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARGP13631 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARGP13631 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARGP13631 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARGP13631 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARGP13631 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARGP13631 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARGP13631 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARGP13631 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARGP13631 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARGP13631 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARGP13631 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RARGP13631 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARGP13631 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARGP13631 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARGP13631 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARGP13631 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARGP13631 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARGP13631 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARGP13631 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARGP13631 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARGP13631 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARGP13631 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARGP13631 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARGP13631 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms