Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NCAM1P13591 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCAM1P13591 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCAM1P13591 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms