Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CFTRP13569 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CFTRP13569 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC40.05■■■■■ 4
CFTRP13569 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CFTRP13569 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CFTRP13569 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CFTRP13569 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CFTRP13569 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
CFTRP13569 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CFTRP13569 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC40.04■■■■■ 4
CFTRP13569 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CFTRP13569 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CFTRP13569 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC40.03■■■■■ 4
CFTRP13569 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CFTRP13569 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CFTRP13569 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CFTRP13569 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
CFTRP13569 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CFTRP13569 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
CFTRP13569 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC40.01■■■■■ 4
CFTRP13569 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC40.01■■■■■ 4
CFTRP13569 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
CFTRP13569 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
CFTRP13569 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CFTRP13569 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CFTRP13569 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC40■■■■□ 3.99
CFTRP13569 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CFTRP13569 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CFTRP13569 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CFTRP13569 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CFTRP13569 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CFTRP13569 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CFTRP13569 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CFTRP13569 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CFTRP13569 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CFTRP13569 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CFTRP13569 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CFTRP13569 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CFTRP13569 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CFTRP13569 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CFTRP13569 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
CFTRP13569 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CFTRP13569 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CFTRP13569 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CFTRP13569 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CFTRP13569 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.99
CFTRP13569 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CFTRP13569 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CFTRP13569 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CFTRP13569 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CFTRP13569 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CFTRP13569 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CFTRP13569 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
CFTRP13569 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CFTRP13569 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFTRP13569 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFTRP13569 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFTRP13569 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFTRP13569 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFTRP13569 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFTRP13569 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFTRP13569 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CFTRP13569 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CFTRP13569 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CFTRP13569 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
CFTRP13569 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CFTRP13569 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CFTRP13569 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CFTRP13569 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CFTRP13569 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CFTRP13569 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CFTRP13569 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CFTRP13569 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFTRP13569 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFTRP13569 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFTRP13569 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFTRP13569 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFTRP13569 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFTRP13569 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFTRP13569 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFTRP13569 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CFTRP13569 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
CFTRP13569 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.98
CFTRP13569 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
CFTRP13569 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CFTRP13569 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CFTRP13569 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CFTRP13569 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CFTRP13569 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CFTRP13569 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CFTRP13569 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CFTRP13569 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CFTRP13569 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
CFTRP13569 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CFTRP13569 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CFTRP13569 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CFTRP13569 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CFTRP13569 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
CFTRP13569 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
CFTRP13569 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms