Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GP1BBP13224 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GP1BBP13224 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GP1BBP13224 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms