Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX4I1P13073 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX4I1P13073 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms