Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL6A2P12110 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL6A2P12110 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL6A2P12110 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms