Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VDRP11473 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDRP11473 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDRP11473 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VDRP11473 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VDRP11473 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VDRP11473 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VDRP11473 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VDRP11473 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VDRP11473 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VDRP11473 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VDRP11473 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VDRP11473 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VDRP11473 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VDRP11473 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VDRP11473 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VDRP11473 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VDRP11473 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VDRP11473 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VDRP11473 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VDRP11473 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VDRP11473 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VDRP11473 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VDRP11473 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VDRP11473 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VDRP11473 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDRP11473 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDRP11473 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDRP11473 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDRP11473 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDRP11473 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDRP11473 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDRP11473 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VDRP11473 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDRP11473 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDRP11473 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VDRP11473 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VDRP11473 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VDRP11473 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VDRP11473 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VDRP11473 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VDRP11473 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VDRP11473 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VDRP11473 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VDRP11473 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VDRP11473 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VDRP11473 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VDRP11473 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VDRP11473 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VDRP11473 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VDRP11473 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VDRP11473 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VDRP11473 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VDRP11473 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDRP11473 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDRP11473 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDRP11473 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDRP11473 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDRP11473 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDRP11473 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDRP11473 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDRP11473 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDRP11473 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDRP11473 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VDRP11473 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VDRP11473 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms