Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB41P11171 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB41P11171 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB41P11171 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB41P11171 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPB41P11171 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPB41P11171 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPB41P11171 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41P11171 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41P11171 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41P11171 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41P11171 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPB41P11171 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41P11171 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41P11171 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41P11171 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41P11171 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41P11171 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPB41P11171 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41P11171 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41P11171 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41P11171 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41P11171 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41P11171 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41P11171 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41P11171 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPB41P11171 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41P11171 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41P11171 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41P11171 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41P11171 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41P11171 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPB41P11171 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41P11171 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41P11171 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41P11171 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41P11171 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41P11171 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41P11171 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41P11171 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41P11171 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41P11171 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41P11171 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPB41P11171 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPB41P11171 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41P11171 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41P11171 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41P11171 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41P11171 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41P11171 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41P11171 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41P11171 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41P11171 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPB41P11171 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EPB41P11171 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41P11171 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EPB41P11171 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41P11171 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41P11171 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41P11171 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41P11171 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EPB41P11171 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41P11171 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41P11171 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms