Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSAP10619 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSAP10619 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTSAP10619 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTSAP10619 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSAP10619 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSAP10619 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSAP10619 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSAP10619 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSAP10619 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSAP10619 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSAP10619 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSAP10619 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSAP10619 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSAP10619 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSAP10619 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSAP10619 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSAP10619 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSAP10619 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSAP10619 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSAP10619 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSAP10619 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSAP10619 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSAP10619 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSAP10619 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSAP10619 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSAP10619 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSAP10619 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSAP10619 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSAP10619 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSAP10619 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSAP10619 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSAP10619 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSAP10619 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSAP10619 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSAP10619 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSAP10619 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSAP10619 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSAP10619 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSAP10619 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSAP10619 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSAP10619 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSAP10619 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSAP10619 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSAP10619 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSAP10619 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSAP10619 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSAP10619 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSAP10619 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSAP10619 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSAP10619 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSAP10619 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSAP10619 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSAP10619 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSAP10619 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSAP10619 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSAP10619 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSAP10619 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSAP10619 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSAP10619 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms