Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP2BP0DMP2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP2BP0DMP2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP2BP0DMP2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms