Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
RGPD2P0DJD1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RGPD2P0DJD1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
RGPD2P0DJD1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGPD2P0DJD1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGPD2P0DJD1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGPD2P0DJD1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RGPD2P0DJD1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
RGPD2P0DJD1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RGPD2P0DJD1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RGPD2P0DJD1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RGPD2P0DJD1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RGPD2P0DJD1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms