Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PATE4P0C8F1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PATE4P0C8F1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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