Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT19P08727 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT19P08727 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT19P08727 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT19P08727 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT19P08727 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT19P08727 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT19P08727 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT19P08727 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT19P08727 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT19P08727 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT19P08727 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT19P08727 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT19P08727 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT19P08727 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT19P08727 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT19P08727 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT19P08727 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT19P08727 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT19P08727 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT19P08727 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT19P08727 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT19P08727 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT19P08727 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT19P08727 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT19P08727 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT19P08727 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT19P08727 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT19P08727 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT19P08727 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT19P08727 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT19P08727 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT19P08727 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT19P08727 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT19P08727 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT19P08727 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT19P08727 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT19P08727 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT19P08727 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT19P08727 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT19P08727 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT19P08727 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT19P08727 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT19P08727 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT19P08727 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT19P08727 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT19P08727 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT19P08727 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT19P08727 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT19P08727 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT19P08727 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT19P08727 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT19P08727 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT19P08727 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT19P08727 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT19P08727 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT19P08727 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT19P08727 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT19P08727 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT19P08727 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT19P08727 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT19P08727 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms