Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ITGA5P08648 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ITGA5P08648 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms