Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYNP07948 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYNP07948 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYNP07948 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNP07948 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNP07948 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNP07948 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNP07948 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNP07948 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNP07948 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNP07948 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNP07948 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYNP07948 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNP07948 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNP07948 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNP07948 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNP07948 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNP07948 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNP07948 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNP07948 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNP07948 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LYNP07948 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNP07948 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNP07948 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNP07948 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNP07948 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNP07948 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNP07948 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNP07948 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNP07948 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNP07948 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LYNP07948 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNP07948 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNP07948 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNP07948 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNP07948 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNP07948 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNP07948 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNP07948 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNP07948 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNP07948 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNP07948 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LYNP07948 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LYNP07948 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LYNP07948 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LYNP07948 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LYNP07948 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LYNP07948 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms