Protein–RNA interactions for Protein: P07864

LDHC, L-lactate dehydrogenase C chain, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHCP07864 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHCP07864 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHCP07864 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHCP07864 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHCP07864 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHCP07864 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHCP07864 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LDHCP07864 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHCP07864 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHCP07864 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHCP07864 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHCP07864 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHCP07864 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHCP07864 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LDHCP07864 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHCP07864 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHCP07864 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHCP07864 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHCP07864 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHCP07864 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHCP07864 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHCP07864 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHCP07864 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHCP07864 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHCP07864 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LDHCP07864 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHCP07864 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHCP07864 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHCP07864 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHCP07864 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHCP07864 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHCP07864 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LDHCP07864 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LDHCP07864 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LDHCP07864 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LDHCP07864 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LDHCP07864 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LDHCP07864 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LDHCP07864 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHCP07864 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHCP07864 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LDHCP07864 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHCP07864 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHCP07864 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHCP07864 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHCP07864 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHCP07864 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHCP07864 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHCP07864 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHCP07864 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHCP07864 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHCP07864 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LDHCP07864 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHCP07864 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHCP07864 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHCP07864 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHCP07864 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHCP07864 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LDHCP07864 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHCP07864 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LDHCP07864 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHCP07864 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHCP07864 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHCP07864 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHCP07864 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHCP07864 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHCP07864 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHCP07864 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LDHCP07864 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LDHCP07864 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LDHCP07864 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LDHCP07864 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LDHCP07864 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LDHCP07864 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LDHCP07864 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LDHCP07864 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LDHCP07864 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LDHCP07864 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LDHCP07864 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LDHCP07864 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDHCP07864 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDHCP07864 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDHCP07864 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LDHCP07864 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDHCP07864 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDHCP07864 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDHCP07864 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDHCP07864 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDHCP07864 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms