Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLBP06746 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLBP06746 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLBP06746 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLBP06746 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLBP06746 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLBP06746 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLBP06746 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLBP06746 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLBP06746 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLBP06746 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLBP06746 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLBP06746 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLBP06746 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLBP06746 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLBP06746 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLBP06746 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLBP06746 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLBP06746 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLBP06746 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLBP06746 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLBP06746 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLBP06746 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLBP06746 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLBP06746 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLBP06746 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLBP06746 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLBP06746 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLBP06746 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLBP06746 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLBP06746 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLBP06746 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLBP06746 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLBP06746 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLBP06746 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLBP06746 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLBP06746 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLBP06746 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLBP06746 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLBP06746 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLBP06746 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLBP06746 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLBP06746 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLBP06746 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLBP06746 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLBP06746 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLBP06746 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLBP06746 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLBP06746 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLBP06746 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLBP06746 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLBP06746 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLBP06746 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLBP06746 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLBP06746 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLBP06746 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLBP06746 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLBP06746 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLBP06746 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLBP06746 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLBP06746 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLBP06746 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLBP06746 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLBP06746 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLBP06746 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLBP06746 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLBP06746 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLBP06746 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLBP06746 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLBP06746 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLBP06746 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLBP06746 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLBP06746 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLBP06746 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLBP06746 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLBP06746 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 803.8 ms