Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA4P06727 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA4P06727 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA4P06727 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA4P06727 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOA4P06727 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA4P06727 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA4P06727 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA4P06727 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA4P06727 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA4P06727 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA4P06727 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA4P06727 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA4P06727 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA4P06727 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA4P06727 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOA4P06727 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA4P06727 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA4P06727 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA4P06727 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA4P06727 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA4P06727 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA4P06727 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA4P06727 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOA4P06727 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA4P06727 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA4P06727 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA4P06727 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA4P06727 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA4P06727 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA4P06727 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA4P06727 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA4P06727 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA4P06727 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA4P06727 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOA4P06727 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA4P06727 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA4P06727 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA4P06727 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA4P06727 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOA4P06727 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA4P06727 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA4P06727 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA4P06727 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA4P06727 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA4P06727 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA4P06727 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA4P06727 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA4P06727 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA4P06727 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA4P06727 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOA4P06727 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA4P06727 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA4P06727 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA4P06727 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA4P06727 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA4P06727 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOA4P06727 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOA4P06727 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOA4P06727 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA4P06727 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA4P06727 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA4P06727 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA4P06727 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA4P06727 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA4P06727 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA4P06727 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA4P06727 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA4P06727 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA4P06727 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOA4P06727 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOA4P06727 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOA4P06727 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA4P06727 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA4P06727 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA4P06727 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOA4P06727 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms