Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3DP05423 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR3DP05423 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR3DP05423 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR3DP05423 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms