Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRKCGP05129 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRKCGP05129 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms