Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGB2P05107 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGB2P05107 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGB2P05107 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms