Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MT-ND1P03886 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND1P03886 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND1P03886 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND1P03886 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND1P03886 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND1P03886 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND1P03886 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND1P03886 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND1P03886 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND1P03886 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-ND1P03886 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-ND1P03886 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-ND1P03886 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms