Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGGP02679 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGGP02679 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGGP02679 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGGP02679 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGGP02679 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGGP02679 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGGP02679 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGGP02679 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGGP02679 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGGP02679 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGGP02679 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGGP02679 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGGP02679 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGGP02679 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FGGP02679 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGGP02679 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGGP02679 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGGP02679 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGGP02679 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGGP02679 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGGP02679 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGGP02679 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
FGGP02679 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FGGP02679 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FGGP02679 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGGP02679 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGGP02679 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGGP02679 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGGP02679 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGGP02679 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGGP02679 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGGP02679 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGGP02679 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGGP02679 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGGP02679 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FGGP02679 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGGP02679 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGGP02679 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGGP02679 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGGP02679 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGGP02679 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGGP02679 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGGP02679 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FGGP02679 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGGP02679 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGGP02679 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms