Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINC1P01008 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SERPINC1P01008 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERPINC1P01008 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SERPINC1P01008 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms