Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
S1PR4O95977 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
S1PR4O95977 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
S1PR4O95977 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms