Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP29O95721 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP29O95721 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP29O95721 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP29O95721 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP29O95721 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP29O95721 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNAP29O95721 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP29O95721 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP29O95721 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP29O95721 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP29O95721 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP29O95721 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP29O95721 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP29O95721 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP29O95721 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNAP29O95721 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNAP29O95721 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNAP29O95721 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP29O95721 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP29O95721 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP29O95721 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP29O95721 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP29O95721 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SNAP29O95721 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SNAP29O95721 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNAP29O95721 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms