Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX6O95475 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX6O95475 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX6O95475 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX6O95475 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX6O95475 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX6O95475 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX6O95475 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX6O95475 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIX6O95475 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX6O95475 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX6O95475 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX6O95475 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX6O95475 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX6O95475 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX6O95475 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SIX6O95475 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX6O95475 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX6O95475 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX6O95475 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX6O95475 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX6O95475 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX6O95475 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX6O95475 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX6O95475 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX6O95475 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SIX6O95475 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SIX6O95475 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX6O95475 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX6O95475 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX6O95475 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX6O95475 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX6O95475 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX6O95475 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SIX6O95475 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX6O95475 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX6O95475 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX6O95475 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX6O95475 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX6O95475 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX6O95475 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX6O95475 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX6O95475 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIX6O95475 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX6O95475 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX6O95475 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX6O95475 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX6O95475 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX6O95475 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIX6O95475 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIX6O95475 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIX6O95475 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX6O95475 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX6O95475 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX6O95475 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX6O95475 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX6O95475 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX6O95475 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SIX6O95475 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms