Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBF1O95248 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBF1O95248 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBF1O95248 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBF1O95248 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBF1O95248 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBF1O95248 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBF1O95248 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBF1O95248 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBF1O95248 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBF1O95248 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBF1O95248 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBF1O95248 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SBF1O95248 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBF1O95248 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBF1O95248 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBF1O95248 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBF1O95248 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBF1O95248 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBF1O95248 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SBF1O95248 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBF1O95248 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SBF1O95248 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBF1O95248 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBF1O95248 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBF1O95248 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SBF1O95248 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SBF1O95248 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SBF1O95248 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBF1O95248 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBF1O95248 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SBF1O95248 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBF1O95248 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBF1O95248 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SBF1O95248 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBF1O95248 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBF1O95248 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBF1O95248 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBF1O95248 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SBF1O95248 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SBF1O95248 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SBF1O95248 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SBF1O95248 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SBF1O95248 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SBF1O95248 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SBF1O95248 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SBF1O95248 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SBF1O95248 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SBF1O95248 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SBF1O95248 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SBF1O95248 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SBF1O95248 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBF1O95248 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBF1O95248 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBF1O95248 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBF1O95248 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBF1O95248 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBF1O95248 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBF1O95248 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBF1O95248 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SBF1O95248 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SBF1O95248 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SBF1O95248 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBF1O95248 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBF1O95248 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBF1O95248 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBF1O95248 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBF1O95248 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SBF1O95248 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SBF1O95248 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SBF1O95248 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SBF1O95248 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SBF1O95248 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SBF1O95248 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SBF1O95248 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SBF1O95248 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SBF1O95248 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SBF1O95248 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SBF1O95248 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SBF1O95248 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SBF1O95248 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SBF1O95248 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SBF1O95248 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SBF1O95248 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SBF1O95248 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SBF1O95248 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SBF1O95248 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SBF1O95248 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SBF1O95248 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SBF1O95248 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBF1O95248 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBF1O95248 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBF1O95248 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBF1O95248 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBF1O95248 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBF1O95248 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBF1O95248 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBF1O95248 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SBF1O95248 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBF1O95248 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms