Protein–RNA interactions for Protein: O94929

ABLIM3, Actin-binding LIM protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM3O94929 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABLIM3O94929 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ABLIM3O94929 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABLIM3O94929 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms